Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep290Q6A078 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cep290Q6A078 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep290Q6A078 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep290Q6A078 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep290Q6A078 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 612 ms