Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc2Q69ZB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc2Q69ZB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc2Q69ZB8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms