Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sptbn2Q68FG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptbn2Q68FG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms