Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab3ipQ68EF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab3ipQ68EF0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms