Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifit1Q64282 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ifit1Q64282 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifit1Q64282 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms