Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc18Q640L5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc18Q640L5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc18Q640L5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc18Q640L5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc18Q640L5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
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