Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp1Q62442 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vamp1Q62442 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms