Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg1Q62433 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg1Q62433 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg1Q62433 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms