Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3gl2Q62420 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3gl2Q62420 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3gl2Q62420 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms