Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl12Q62401 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms