Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrhQ62361 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TrhQ62361 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TrhQ62361 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TrhQ62361 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TrhQ62361 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TrhQ62361 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TrhQ62361 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms