Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TfrcQ62351 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms