Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sos1Q62245 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sos1Q62245 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sos1Q62245 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sos1Q62245 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sos1Q62245 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms