Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Six1Q62231 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Six1Q62231 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Six1Q62231 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Six1Q62231 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six1Q62231 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six1Q62231 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Six1Q62231 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six1Q62231 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Six1Q62231 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Six1Q62231 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Six1Q62231 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Six1Q62231 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Six1Q62231 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Six1Q62231 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Six1Q62231 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Six1Q62231 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms