Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sycp1Q62209 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sycp1Q62209 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sycp1Q62209 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms