Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Scn9aQ62205 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scn9aQ62205 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scn9aQ62205 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms