Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Sin3bQ62141 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sin3bQ62141 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3bQ62141 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms