Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcbp2Q61990 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp2Q61990 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp2Q61990 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms