Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Npm1Q61937 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Npm1Q61937 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm1Q61937 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Npm1Q61937 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm1Q61937 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms