Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd55bQ61476 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd55bQ61476 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms