Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msi1Q61474 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi1Q61474 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Msi1Q61474 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi1Q61474 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi1Q61474 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi1Q61474 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msi1Q61474 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi1Q61474 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi1Q61474 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Msi1Q61474 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi1Q61474 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi1Q61474 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msi1Q61474 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msi1Q61474 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msi1Q61474 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msi1Q61474 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msi1Q61474 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msi1Q61474 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msi1Q61474 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msi1Q61474 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms