Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift88Q61371 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift88Q61371 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift88Q61371 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms