Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna2Q61301 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna2Q61301 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnna2Q61301 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms