Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Arhgef1Q61210 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Arhgef1Q61210 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Arhgef1Q61210 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef1Q61210 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef1Q61210 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef1Q61210 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms