Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pafah1b2Q61206 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pafah1b2Q61206 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pafah1b2Q61206 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms