Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsg101Q61187 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tsg101Q61187 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms