Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Foxg1Q60987 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms