Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik1Q60934 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms