Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnot7Q60809 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot7Q60809 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms