Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkn2cQ60772 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkn2cQ60772 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cdkn2cQ60772 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkn2cQ60772 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms