Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atf3Q60765 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atf3Q60765 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atf3Q60765 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms