Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Epha1Q60750 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Epha1Q60750 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha1Q60750 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms