Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samhd1Q60710 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samhd1Q60710 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samhd1Q60710 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms