Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HnrnpdQ60668 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HnrnpdQ60668 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms