Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q5XFZ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q5XFZ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q5XFZ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms