Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a4Q5XF90 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a4Q5XF90 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a4Q5XF90 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms