Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf15Q5UBV8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf15Q5UBV8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms