Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim38Q5SZ99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Trim38Q5SZ99 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Trim38Q5SZ99 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim38Q5SZ99 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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