Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsr1Q5SWD9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsr1Q5SWD9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsr1Q5SWD9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms