Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r195Q5SVD6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r195Q5SVD6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r195Q5SVD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms