Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PfasQ5SUR0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PfasQ5SUR0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PfasQ5SUR0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms