Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ankrd40Q5SUE8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms