Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf12Q5SPL2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Phf12Q5SPL2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Phf12Q5SPL2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 470.8 ms