Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85aQ5SP85 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85aQ5SP85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms