Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms