Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trdv4Q5R1A3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms