Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms