Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hs3st6Q5GFD5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hs3st6Q5GFD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms