Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q5EBG8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q5EBG8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q5EBG8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q5EBG8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms