Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfmbt2Q5DTW2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sfmbt2Q5DTW2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sfmbt2Q5DTW2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms